真菌感染主要是抗真菌药物，这类药物临床常用的是含有酮康唑类、盐酸特比萘芬等成分的药物和中药。 局部皮肤真菌感染可局部用药，全身真菌感染可增加药浴、注射等进行全身治疗，也可通过使用皮肤养分增强皮肤抵抗力辅助治疗。

对于感染狗脚趾的真菌，建议使用含有特比萘芬成分的药物进行治疗。 但主人首先要给狗戴上伊丽莎白，避免狗因脚趾瘙痒反复舔食，一方面可能加重狗脚趾感染，另一方面也要注意这类药物有一定毒性，可能导致狗舔中毒。 其次，建议给狗喂保护皮肤健康的健康食品，不要让皮肤感染真菌。 真菌感染采用含酮康唑、伊曲康唑、特比萘芬的药物治疗效果较好。 真菌感染会引起瘙痒、患处脱发、斑疹等症状，具有传染性，可传染给宠物身体其他部位，建议饲主不要让宠物搔抓患处，以免引起患处溃烂、二次感染。 用药前需将患处用毛刮干净，使药物能充分接触皮肤。犬耳真菌感染可采用含特比萘芬、伊曲康唑、酮康唑等成分的广谱抗真菌药物治疗。 犬耳真菌感染时，一般出现耳皮肤发红，表面有红色丘疹，伴有异味和强烈瘙痒感，犬常摇头挠耳。 使用耳药前，建议饲主用洗耳水清洁狗的耳朵，然后将耳药推入狗的耳道。 使用频率因狗耳朵的感染程度而异。

犬皮肤真菌感染需要抗真菌治疗药物，如含盐酸特比萘芬、伊曲康唑等成分的药物治疗，治疗期间还可以联合使用抗真菌药浴洗发水，以达到更好的治愈效果。 犬皮肤真菌感染通常是由犬小孢子菌、石膏样小孢子菌和须发癣菌引起的感染，多由犬居住环境潮湿、洗澡后不能及时吹干、营养不良等原因引起。