当狗狗患有乳腺囊肿时，建议做以下处理：第一，如果是恶性乳腺囊肿，不建议手术切除，因为切除后可能会重新生长。第二，如果是良性囊肿，可以选择手术切除，要进行区域切除，防止继续生长。第三，乳腺囊肿的根本原因是激素，建议尽早绝育。

需要对囊肿中的分泌物进行细胞学检查，以查看是否有任何感染。如果只是普通的血肿，可以引流来抗菌伤口，促进伤口的修复。如果有感染，需要用细针将囊肿内的分泌物吸出，并进行注射、药物等抗菌治疗。