小猫的染色体有一半来自公猫，一般来自母猫，遗传基因位于染色体上，所以正常情况下，公猫和母猫染色体上的基因比例是一样的。但母猫的卵细胞中也含有线粒体，线粒体中含有某些基因，所以相对来说，母猫可能会把更多的基因传递给幼猫。

猫的基因是公猫母猫平分秋色。但是因为基因和基因表达不一定一样，所以看起来都像公猫，有的像母猫。比如短毛猫基本都是野生的，这种类型占优势。大多数特定的毛色和图案不是简单的“是或不是”的遗传特征。而是不同染色体上多个基因相互作用的结果。其中一个例外是猫的纯白毛色，对于毛色基因决定的其他所有表现型，纯白表现型都是显性的。目前唯一已知的决定猫颜色的性连锁基因是X染色体的真黑色素钝化橙基因。显性等位基因为O的纯合母猫毛色为橙色，公猫为显性等位基因。杂合母猫皮肤的某些区域有真黑色素钝化，而其他区域没有钝化，所以呈现龟甲色。如果有斑点等位基因，他们也可能有类似印花布的标记。

公猫和母猫的区别主要来自体内的激素水平。与母猫相比，公猫在性格上会更加独立，同时也会更加暴躁。如果喜欢温顺依赖的猫，建议喂母猫。然而，在发情期，母猫往往比公猫反应更大。其实公猫和母猫没有太大区别。公猫母猫都可以喂。